【作者】 龚世杰
【关键词】 rDNA 多样性 老爷庙水域 鄱阳湖 细菌 16S RFLP
【导师姓名】李思光;吴兰
【学位名称】硕士
【学位年度】2009
【授予单位】南昌大学
【分类号】 Q938.8
【录入时间】2017-05-14
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【摘要】鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表......
【全文】鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...