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基于线粒体控制区全序列的鄱阳湖水系鲢增殖放流群体与野生群体的遗传多样性分析
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作者:
陈文静 张燕萍 段辛斌 徐先栋 汪澄强 来源:中国农学通报 年份:2013 文献类型 :期刊 关键词: 鲢 增殖放流 种群遗传结构 线粒体DNA控制区 水产养殖
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描述:为了确定增殖放流活动是否会导致鄱阳湖水系天然鲢出现遗传结构分化,本研究利用线粒体控制区序列研究了鄱阳湖水系增殖放流群体与野生鲢群体的遗传多样性水平和遗传结构。通过PCR扩增与序列测定增殖放流和野生鲢群体获得了长度为935 bp的线粒体控制区基因片段。54条线粒体控制区序列经比对后,发现41个变异位点,共定义了24个单倍型,其中有一单倍型(Hap6)为三个种群所共享。遗传多样性分析表明:赣江的单倍型多样性(0.727±0.077)和核苷酸多样性(0.00897±0.00168)均低于瑞昌和增殖放流群体;AMOVA分析表明:遗传变异主要来自种群内,占77.61%,而野生群体与增殖群体间只有22.39%,各种群间成对的Fst及遗传距离均表现种群间出现了一定程度的种群分化,但系统进化树显示出一种混杂的单位型分布格局,没有出现明显的谱系结构和地理聚群。单倍型岐点分布呈现为双峰以及中性检验Tajima的D(0.70106,P=0.8240.10)和Fu的Fs(-1.007,P=0.410)。结果综合表明,鄱阳湖水系野生鲢群体与增殖放流群体可能未经历过近期的种群扩张事件。以上结果表明,赣江群体单倍型多样性及核苷酸多样性最低,应加以保护;增殖放流鲢群体引起鄱阳湖水系自然鲢遗传结构的分化,应进一步规范放流,并制定操作规程。
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全文:为了确定增殖放流活动是否会导致鄱阳湖水系天然鲢出现遗传结构分化,本研究利用线粒体控制区序列研究了鄱阳湖水系增殖放流群体与野生鲢群体的遗传多样性水平和遗传结构。通过PCR扩增与序列测定增殖放流和野生鲢群体获得了长度为935 bp的线粒体控制区基因片段。54条线粒体控制区序列经比对后,发现41个变异位点,共定义了24个单倍型,其中有一单倍型(Hap6)为三个种群所共享。遗传多样性分析表明:赣江的单倍型多样性(0.727±0.077)和核苷酸多样性(0.00897±0.00168)均低于瑞昌和增殖放流群体;AMOVA分析表明:遗传变异主要来自种群内,占77.61%,而野生群体与增殖群体间只有22.39%,各种群间成对的Fst及遗传距离均表现种群间出现了一定程度的种群分化,但系统进化树显示出一种混杂的单位型分布格局,没有出现明显的谱系结构和地理聚群。单倍型岐点分布呈现为双峰以及中性检验Tajima的D(0.70106,P=0.8240.10)和Fu的Fs(-1.007,P=0.410)。结果综合表明,鄱阳湖水系野生鲢群体与增殖放流群体可能未经历过近期的种群扩张事件。以上结果表明,赣江群体单倍型多样性及核苷酸多样性最低,应加以保护;增殖放流鲢群体引起鄱阳湖水系自然鲢遗传结构的分化,应进一步规范放流,并制定操作规程。