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鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码

日期:2015.01.01 点击数:24

【类型】期刊

【作者】徐武杰 邹节新 白俊 朱春潮 石林波 张小燕 张萌 汪雁 周宪民 

【刊名】南昌大学学报(理科版)

【关键词】 鄱阳湖流域 DNA条形码 COI 华溪蟹属

【基金项目】国家自然科学基金项目(81260257,81160207,31460156,31560179);江西省自然科学基金(20132bab205059);江西省医学科研项目(20122025);江西省教育厅项目(gjj12084);南昌大学研究生创新专项资金(cx2015180)

【摘要】探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。

【年份】2015

【期号】第4期

【ISSN  号】1006-0464

【页码】402-408

【全文传递】获取全文

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