【作者】 赵翔
【导师姓名】吴国娟;王大燕
【学位名称】硕士
【学位年度】2016
【授予单位】北京农学院
【分类号】 S858.32
【录入时间】2017-05-14
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【摘要】江西鄱阳湖是主要的候鸟栖息地是东亚-澳大利亚候鸟迁徙路线的必经之地,这给周边散养家禽和候鸟之间的接触创造了条件,增加了禽流感病毒在野鸟和家禽之间的传播几率。本研究选取鄱阳湖周边7个县区的养殖户进行入户采样和调查,通过研究了解禽流感各亚型在家鸭中的流行情况,并对其进行基因进化和分子特征分析,了解其基因进化情况及耐药风险。2014年在江西鄱阳湖周边七个区县的户家鸭养殖场采集粪便和水样等环境样本共计3467份,将采集的样本使用无特定病原体(SPF)鸡胚进行病毒分离,使用红细胞凝集试验进行初筛,再使用荧光实时反转录聚合酶链反应(Real-time PCR)方法确定甲型流感病毒,随后进行二代测序实验,得到全基因组序列后进行分子进化和耐药位点分析。所有采集的环境样本,血凝阳性率为3.18%(109/3425),血凝阳性标本中甲型流感核酸阳性率为44.95%(49/109),49份标本中分离到了禽流感病毒,其中H10N3亚型2株,H11N3亚型2株,H12N5亚型2株,H3N2亚型5株,H3N3亚型2株,H3N6亚型8株,H3N8亚型5株,H4N6亚型8株,H5N6亚型3株,H6N1亚型1株,H6N6亚型4株,H7N7亚型3株,混型4株。3株H5N6毒株,HA基因属于clade2.3.4.4分支,其6个内部片段均来源于H5N6亚型。耐药位点分析结果显示,金刚烷胺类和神经氨酸酶抑制剂均敏感。鄱阳湖地区饲养的家禽中流行共监测到H10N3, H11N3, H12N5, H3N2, H3N3, H3N6, H3N8, H4N6, H5N6, H6N1, H6N6, H7N7,混型等亚型流行,其中H5N6存在感染人的风险。...
【全文】江西鄱阳湖是主要的候鸟栖息地是东亚-澳大利亚候鸟迁徙路线的必经之地,这给周边散养家禽和候鸟之间的接触创造了条件,增加了禽流感病毒在野鸟和家禽之间的传播几率。本研究选取鄱阳湖周边7个县区的养殖户进行入户采样和调查,通过研究了解禽流感各亚型在家鸭中的流行情况,并对其进行基因进化和分子特征分析,了解其基因进化情况及耐药风险。2014年在江西鄱阳湖周边七个区县的户家鸭养殖场采集粪便和水样等环境样本共计3467份,将采集的样本使用无特定病原体(SPF)鸡胚进行病毒分离,使用红细胞凝集试验进行初筛,再使用荧光实时反转录聚合酶链反应(Real-time PCR)方法确定甲型流感病毒,随后进行二代测序实验,得到全基因组序列后进行分子进化和耐药位点分析。所有采集的环境样本,血凝阳性率为3.18%(109/3425),血凝阳性标本中甲型流感核酸阳性率为44.95%(49/109),49份标本中分离到了禽流感病毒,其中H10N3亚型2株,H11N3亚型2株,H12N5亚型2株,H3N2亚型5株,H3N3亚型2株,H3N6亚型8株,H3N8亚型5株,H4N6亚型8株,H5N6亚型3株,H6N1亚型1株,H6N6亚型4株,H7N7亚型3株,混型4株。3株H5N6毒株,HA基因属于clade2.3.4.4分支,其6个内部片段均来源于H5N6亚型。耐药位点分析结果显示,金刚烷胺类和神经氨酸酶抑制剂均敏感。鄱阳湖地区饲养的家禽中流行共监测到H10N3, H11N3, H12N5, H3N2, H3N3, H3N6, H3N8, H4N6, H5N6, H6N1, H6N6, H7N7,混型等亚型流行,其中H5N6存在感染人的风险。