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鄱阳湖水体细菌群落组成及遗传多样性
作者: 吴兰 葛刚 龚世杰 朱国锋 万金宝  来源:环境科学研究 年份:2009 文献类型 :期刊 关键词: 16SrRNA基因文库  鄱阳湖  细菌多样性  限制性内切酶长度多态性 
描述:利用建立细菌16S rRNA基因文库和限制性内切酶长度多态性(RFLP)分析的方法,对鄱阳湖南、北湖区水体的细菌多样性进行了研究.结果表明,鄱阳湖水体细菌多样性较高,且南湖区2007年水体的细菌多样性明显高于其2006年水体和北湖区水体.主要细菌组成分析表明,鄱阳湖水体中的349个阳性克隆代表的167种基因型分别属于十大细菌类群,变形菌门(Proteobacteria)在4个克隆文库中占据了47%~81%,数量极其丰富,尤其是亚型的β-变形菌为优势菌群;拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)也广泛分布,且有2.9%~17.1%的克隆数属于未分类细菌.研究结果进一步提示鄱阳湖水体有一定程度的富营养化.
全文:利用建立细菌16S rRNA基因文库和限制性内切酶长度多态性(RFLP)分析的方法,对鄱阳湖南、北湖区水体的细菌多样性进行了研究.结果表明,鄱阳湖水体细菌多样性较高,且南湖区2007年水体的细菌多样性明显高于其2006年水体和北湖区水体.主要细菌组成分析表明,鄱阳湖水体中的349个阳性克隆代表的167种基因型分别属于十大细菌类群,变形菌门(Proteobacteria)在4个克隆文库中占据了47%~81%,数量极其丰富,尤其是亚型的β-变形菌为优势菌群;拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)也广泛分布,且有2.9%~17.1%的克隆数属于未分类细菌.研究结果进一步提示鄱阳湖水体有一定程度的富营养化.
鄱阳湖北湖细菌多样性研究
作者: 龚世杰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  多样性  老爷庙水域  鄱阳湖  细菌  16S  RFLP 
描述:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
全文:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
鄱阳湖北湖细菌多样性研究
作者: 龚世杰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  多样性  老爷庙水域  鄱阳湖  细菌  16S  RFLP 
描述:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
全文:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
鄱阳湖北湖细菌多样性研究
作者: 龚世杰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  多样性  老爷庙水域  鄱阳湖  细菌  16S  RFLP 
描述:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
全文:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
鄱阳湖水体细菌物种多样性研究
作者: 吴兰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 
描述:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...
全文:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...
鄱阳湖水体细菌物种多样性研究
作者: 吴兰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 
描述:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...
全文:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...
鄱阳湖水体细菌物种多样性研究
作者: 吴兰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 
描述:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...
全文:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...
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