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基于SSR和ISSR的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析
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作者:
王惠梅 吴国林 江绍琳 黄奇娜 奉保华 黄长干 江绍玫 吴建利 来源:植物遗传资源学报 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 菰 遗传多样性 居群 ISSR标记 SSR标记
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描述:用SSR和ISSR标记对鄱阳湖流域30个野生菰居群的遗传多样性与遗传结构进行了分析。筛选出的19对SSR引物共扩增出多态性条带253条,平均多态性条带比率(PPB)为91.67%,Nei’s基因多样性指数(He)和平均Shannon信息指数(I)分别为0.2712和0.4144,遗传相似性系数(GS)为0.5590~0.8368,遗传距离(GD)的变化范围为0.1632~0.4410;筛选出的14个ISSR标记引物共扩增出83条条带,平均多态性条带比率(PPB)为78.29%,Nei’s基因多样性指数(He)和平均Shannon信息指数(I)分别为0.2386和0.4174,遗传相似性系数(GS)为0.5132~0.9342,遗传距离(GD)变化范围为0.0658~0.4868。根据SSR和ISSR基因型数据,采用UPGMA法分别在阈值为0.698和0.728时可将30个野生菰居群聚为3类。可能受人为、水流、动物活动、风等多种因素的影响,居群间的亲缘关系与地理分布无明显相关性。本研究表明,鄱阳湖流域野生菰居群间SSR和ISSR基因型的多样性丰富,居群间的这种遗传差异或变异,对该地区乃至更大范围内野生菰的遗传进化、基因资源的开发利用和种质资源的保护有着重要意义。
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全文:用SSR和ISSR标记对鄱阳湖流域30个野生菰居群的遗传多样性与遗传结构进行了分析。筛选出的19对SSR引物共扩增出多态性条带253条,平均多态性条带比率(PPB)为91.67%,Nei’s基因多样性指数(He)和平均Shannon信息指数(I)分别为0.2712和0.4144,遗传相似性系数(GS)为0.5590~0.8368,遗传距离(GD)的变化范围为0.1632~0.4410;筛选出的14个ISSR标记引物共扩增出83条条带,平均多态性条带比率(PPB)为78.29%,Nei’s基因多样性指数(He)和平均Shannon信息指数(I)分别为0.2386和0.4174,遗传相似性系数(GS)为0.5132~0.9342,遗传距离(GD)变化范围为0.0658~0.4868。根据SSR和ISSR基因型数据,采用UPGMA法分别在阈值为0.698和0.728时可将30个野生菰居群聚为3类。可能受人为、水流、动物活动、风等多种因素的影响,居群间的亲缘关系与地理分布无明显相关性。本研究表明,鄱阳湖流域野生菰居群间SSR和ISSR基因型的多样性丰富,居群间的这种遗传差异或变异,对该地区乃至更大范围内野生菰的遗传进化、基因资源的开发利用和种质资源的保护有着重要意义。
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鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
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作者:
刘芳鹏 来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌 克隆文库 氨氧化细菌 表层沉积物 鄱阳湖 qPCR 反硝化细菌
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描述:,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
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全文:,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
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鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
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作者:
刘芳鹏 来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌 克隆文库 氨氧化细菌 表层沉积物 鄱阳湖 qPCR 反硝化细菌
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描述:,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
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全文:,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
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鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
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作者:
刘芳鹏 来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌 克隆文库 氨氧化细菌 表层沉积物 鄱阳湖 qPCR 反硝化细菌
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描述:,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
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全文:,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
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基于GPS遥测的江西鄱阳湖越冬白枕鹤(Grus vipio)活动区和栖息地选择研究
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作者:
程雅畅 来源:北京林业大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: GPS遥测 白枕鹤 栖息地选择 鄱阳湖 活动区
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描述:期间的活动区面积、核域面积和重叠指数(overlap index),并利用选择率特征分析、成分分析、逻辑斯谛回归和资源选择函数等方法对越冬白枕鹤多尺度栖息地选择进行研究。主要结果如下:(1)研究期内
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全文:期间的活动区面积、核域面积和重叠指数(overlap index),并利用选择率特征分析、成分分析、逻辑斯谛回归和资源选择函数等方法对越冬白枕鹤多尺度栖息地选择进行研究。主要结果如下:(1)研究期内
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基于GPS遥测的江西鄱阳湖越冬白枕鹤(Grus vipio)活动区和栖息地选择研究
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作者:
程雅畅 来源:北京林业大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: GPS遥测 白枕鹤 栖息地选择 鄱阳湖 活动区
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描述:期间的活动区面积、核域面积和重叠指数(overlap index),并利用选择率特征分析、成分分析、逻辑斯谛回归和资源选择函数等方法对越冬白枕鹤多尺度栖息地选择进行研究。主要结果如下:(1)研究期内
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全文:期间的活动区面积、核域面积和重叠指数(overlap index),并利用选择率特征分析、成分分析、逻辑斯谛回归和资源选择函数等方法对越冬白枕鹤多尺度栖息地选择进行研究。主要结果如下:(1)研究期内
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基于GPS遥测的江西鄱阳湖越冬白枕鹤(Grus vipio)活动区和栖息地选择研究
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作者:
程雅畅 来源:北京林业大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: GPS遥测 白枕鹤 栖息地选择 鄱阳湖 活动区
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描述:期间的活动区面积、核域面积和重叠指数(overlap index),并利用选择率特征分析、成分分析、逻辑斯谛回归和资源选择函数等方法对越冬白枕鹤多尺度栖息地选择进行研究。主要结果如下:(1)研究期内
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全文:期间的活动区面积、核域面积和重叠指数(overlap index),并利用选择率特征分析、成分分析、逻辑斯谛回归和资源选择函数等方法对越冬白枕鹤多尺度栖息地选择进行研究。主要结果如下:(1)研究期内