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鄱阳湖北湖细菌多样性研究
作者: 龚世杰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  多样性  老爷庙水域  鄱阳湖  细菌  16S  RFLP 
描述:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
全文:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
鄱阳湖北湖细菌多样性研究
作者: 龚世杰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  多样性  老爷庙水域  鄱阳湖  细菌  16S  RFLP 
描述:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
全文:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
鄱阳湖北湖细菌多样性研究
作者: 龚世杰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  多样性  老爷庙水域  鄱阳湖  细菌  16S  RFLP 
描述:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
全文:鄱阳湖位于长江中下游,江西省北部,是我国第一大淡水湖,它是一过水性、吞吐型湖泊。该湖北湖主湖区——老爷庙水域位于鄱阳湖盆地北部,为鄱阳湖入长江的咽喉要处,是江西省内河水运通往长江、长江水运进入江西的必经之道。该水域生态环境复杂,是研究鄱阳湖微生物多样性的理想场所。 本论文首次通过16S rDNA-RFLP(16S rDNA restriction fragment lengthpolymorphism)的分子生物学方法直接从鄱阳湖老爷庙水域的贫水期水样和丰水期水样中提取总DNA,通过PCR扩增两个水样的16S rDNA,构建了16S rDNA文库,并且利用HaeⅢ和HinfⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行了RFLP分析。酶切结果进一步通过Biotools软件(Biological ToolBox version 0.10)和AnalyticRarefaction(version 1.3)分析,而后对每个分类单元的克隆子都进行了测序分析,将序列提交到国际分子生物学数据库(GenBank)进行Blast相似性比较,用MEGA(version 4.0)软件构建系统发育树进行系统发育分析,结果表...
鄱阳湖水体细菌物种多样性研究
作者: 吴兰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 
描述:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌
全文:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌
鄱阳湖水体细菌物种多样性研究
作者: 吴兰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 
描述:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌
全文:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌
鄱阳湖水体细菌物种多样性研究
作者: 吴兰  来源:南昌大学 年份:2009 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 
描述:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌
全文:本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌
鄱阳湖表层水体细菌群落结构时空变化
作者: 刘倩纯  来源:南昌大学 年份:2013 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  454高通量测序  鄱阳湖  细菌多样性  DGGE  16S 
描述:菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门:与2010年10月相比,2011年5
全文:菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门:与2010年10月相比,2011年5
鄱阳湖表层水体细菌群落结构时空变化
作者: 刘倩纯  来源:南昌大学 年份:2013 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  454高通量测序  鄱阳湖  细菌多样性  DGGE  16S 
描述:菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门:与2010年10月相比,2011年5
全文:菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门:与2010年10月相比,2011年5
鄱阳湖表层水体细菌群落结构时空变化
作者: 刘倩纯  来源:南昌大学 年份:2013 文献类型 :学位论文 关键词: rDNA  454高通量测序  鄱阳湖  细菌多样性  DGGE  16S 
描述:菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门:与2010年10月相比,2011年5
全文:菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门:与2010年10月相比,2011年5
鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
作者: 刘芳鹏  来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌  克隆文库  氨氧化细菌  表层沉积物  鄱阳湖  qPCR  反硝化细菌 
描述:分布的主要影响因子是TOC、TP、Cu和Zn,而与反硝化细菌丰度显著相关的环境因子是TOC。综上,营养元素和重金属元素是影响鄱阳湖沉积物微生物群落结构、组成、多样性和丰度的重要因素。此外,鄱阳湖沉积物氨氧化细菌丰度比反硝化细菌细菌丰度要高到1-2个数量级,推测氨氧化细菌群落比反硝化细菌群落活性高。
全文:分布的主要影响因子是TOC、TP、Cu和Zn,而与反硝化细菌丰度显著相关的环境因子是TOC。综上,营养元素和重金属元素是影响鄱阳湖沉积物微生物群落结构、组成、多样性和丰度的重要因素。此外,鄱阳湖沉积物氨氧化细菌丰度比反硝化细菌细菌丰度要高到1-2个数量级,推测氨氧化细菌群落比反硝化细菌群落活性高。
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