鄱阳湖水体细菌物种多样性研究

作者： 吴兰  来源：南昌大学 年份：2009 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 

描述：本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...

全文：本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...

鄱阳湖水体细菌物种多样性研究

作者： 吴兰  来源：南昌大学 年份：2009 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 

描述：本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...

全文：本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...

鄱阳湖水体细菌物种多样性研究

作者： 吴兰  来源：南昌大学 年份：2009 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖  细菌多样性  16SrDNA文库  限制性片段长度多态性分析 

描述：本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...

全文：本研究采用细菌16SrDNA序列分析的分子生物学技术对鄱阳湖南北主湖区水体细菌多样性进行了系统研究。其结果如下: ①.北湖平水期(2006年10月样)水域的细菌分属于八大细菌类群:变形菌门的α-,β-,γ-,Epsilon和未知分类地位的变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,酸杆菌门,浮霉菌门。 ②.北湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下七大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,OP10,浮霉菌门,以及未知分类地位细菌。 ③.南湖平水期水域(2006年10月样)的细菌分属于以下九大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌门,放线菌门,拟杆菌门,OP10,蓝细菌,疣微菌门,硝化螺旋菌门以及未知分类地位细菌。 ④.南湖丰水期(2007年5月样)水域的细菌分属于以下八大细菌类群中:变形菌门的α-,β-,γ-变形细菌纲,放线菌门,拟杆菌门,蓝细菌,疣微菌门,浮霉菌以及未知分类地位细菌。 鄱阳湖水体细菌主要由不可培养菌组成,细菌群落明显受季节影响,南湖水体细菌的丰富度和多样性高于北湖。北湖平水期和丰水期...

基于高通量测序的鄱阳湖典型湿地土壤细菌群落特征分析

作者： 王鹏 陈波 张华  来源：生态学报 年份：2017 文献类型 ：期刊 关键词： 鄱阳湖湿地  细菌群落结构  细菌多样性  高通量测序 

描述：采用高通量测序技术分析了鄱阳湖典型湿地土壤细菌群落特征。测序结果表明,不同植被土壤细菌群落丰度与多样性的排序相同:苔草带>苔草-虉草带>芦苇带>泥滩带>藜蒿带。沿湖面至坡地,空间位置相近的土壤细菌群落结构具有更大的相似性,苔草-虉草带、苔草带和芦苇带的细菌群落结构相近,泥滩带和藜蒿带的细菌群落结构差异较大。变形菌门(30.0%)是湿地土壤平均相对丰度最高的门,其次为酸杆菌门(16.7%)和绿弯菌门(16.5%);多数门分类细菌相对丰度沿湖面至坡地存在一定变化趋势。硝化螺菌属是第一大属分类水平细菌群落。在土壤化学指标中,与鄱阳湖湿地细菌群落相关性较大的是总磷、铵态氮和有机质含量。以上研究结果表明,鄱阳湖湿地不同植被土壤细菌群落具有结构性差异,但沿湖面至坡地存在规律性变化。

全文：采用高通量测序技术分析了鄱阳湖典型湿地土壤细菌群落特征。测序结果表明,不同植被土壤细菌群落丰度与多样性的排序相同:苔草带>苔草-虉草带>芦苇带>泥滩带>藜蒿带。沿湖面至坡地,空间位置相近的土壤细菌群落结构具有更大的相似性,苔草-虉草带、苔草带和芦苇带的细菌群落结构相近,泥滩带和藜蒿带的细菌群落结构差异较大。变形菌门(30.0%)是湿地土壤平均相对丰度最高的门,其次为酸杆菌门(16.7%)和绿弯菌门(16.5%);多数门分类细菌相对丰度沿湖面至坡地存在一定变化趋势。硝化螺菌属是第一大属分类水平细菌群落。在土壤化学指标中,与鄱阳湖湿地细菌群落相关性较大的是总磷、铵态氮和有机质含量。以上研究结果表明,鄱阳湖湿地不同植被土壤细菌群落具有结构性差异,但沿湖面至坡地存在规律性变化。

鄱阳湖湖泊细菌群落组成及结构——以松门山为例

作者： 寇文伯 黄正云 张杰 刘倩纯 刘芳鹏 刘以珍 吴兰  来源：生态学报 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： 鄱阳湖  高通量测序  细菌多样性  细菌群落组成 

描述：于2011年5月在鄱阳湖——松门山湖区采集底泥与表层水样,分别提取了表层水体浮游和底泥微生物基因组DNA,利用454高通量测序技术对细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了湖泊底泥细菌、水体浮游细菌群落结构特征。结果显示:底泥细菌OTUs(Operational Taxonomic Units)为1454,表层水体浮游细菌OTUs为269;底泥细菌群落比表层水体更加多样化,底泥细菌的物种数大大多于表层水体。同时,底泥细菌群落与表层浮游细菌群落结构存在显著差异。物种分类显示鄱阳湖底泥细菌种类隶属于20门,228属,其中优势种群为δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia);表层水体浮游细菌隶属于13门116属,优势种群为β-变形菌纲、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。结果进一步揭示,无论是浮游细菌群落还是沉积物细菌群落,优势细菌种群的基因型多样性更高。

全文：于2011年5月在鄱阳湖——松门山湖区采集底泥与表层水样,分别提取了表层水体浮游和底泥微生物基因组DNA,利用454高通量测序技术对细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了湖泊底泥细菌、水体浮游细菌群落结构特征。结果显示:底泥细菌OTUs(Operational Taxonomic Units)为1454,表层水体浮游细菌OTUs为269;底泥细菌群落比表层水体更加多样化,底泥细菌的物种数大大多于表层水体。同时,底泥细菌群落与表层浮游细菌群落结构存在显著差异。物种分类显示鄱阳湖底泥细菌种类隶属于20门,228属,其中优势种群为δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia);表层水体浮游细菌隶属于13门116属,优势种群为β-变形菌纲、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。结果进一步揭示,无论是浮游细菌群落还是沉积物细菌群落,优势细菌种群的基因型多样性更高。

鄱阳湖水体细菌群落组成及遗传多样性

作者： 吴兰 葛刚 龚世杰 朱国锋 万金宝  来源：环境科学研究 年份：2009 文献类型 ：期刊 关键词： 16SrRNA基因文库  鄱阳湖  细菌多样性  限制性内切酶长度多态性 

描述：利用建立细菌16S rRNA基因文库和限制性内切酶长度多态性(RFLP)分析的方法,对鄱阳湖南、北湖区水体的细菌多样性进行了研究.结果表明,鄱阳湖水体细菌多样性较高,且南湖区2007年水体的细菌多样性明显高于其2006年水体和北湖区水体.主要细菌组成分析表明,鄱阳湖水体中的349个阳性克隆代表的167种基因型分别属于十大细菌类群,变形菌门(Proteobacteria)在4个克隆文库中占据了47%~81%,数量极其丰富,尤其是亚型的β-变形菌为优势菌群;拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)也广泛分布,且有2.9%~17.1%的克隆数属于未分类细菌.研究结果进一步提示鄱阳湖水体有一定程度的富营养化.

全文：利用建立细菌16S rRNA基因文库和限制性内切酶长度多态性(RFLP)分析的方法,对鄱阳湖南、北湖区水体的细菌多样性进行了研究.结果表明,鄱阳湖水体细菌多样性较高,且南湖区2007年水体的细菌多样性明显高于其2006年水体和北湖区水体.主要细菌组成分析表明,鄱阳湖水体中的349个阳性克隆代表的167种基因型分别属于十大细菌类群,变形菌门(Proteobacteria)在4个克隆文库中占据了47%~81%,数量极其丰富,尤其是亚型的β-变形菌为优势菌群;拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)也广泛分布,且有2.9%~17.1%的克隆数属于未分类细菌.研究结果进一步提示鄱阳湖水体有一定程度的富营养化.

鄱阳湖7个河口水体中细菌多样性和组成特征

作者： 圣平 于一尊 田晓娟 黄江丽 张志红 丁建南  来源：农业现代化研究 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 不同河口水样  7大河口  鄱阳湖  细菌多样性  细菌群落组成 

描述：本文对鄱阳湖7个河口(赣江、抚河、信江、乐安河、昌江、饶河和修河)水体的理化特性进行了分析,并采用细菌16S r RNA基因Mi Seq测序的方法对其多样性和组成进行了研究。结果表明,乐安河水体总氮含量最高,信江水体总磷含量最高。乐安河、修河和饶河水体细菌丰度高于其它河口,而修河、昌江和饶河水体细菌多样性则相对较高。水体细菌群落组成分析结果表明,在7个河口水体中变形菌门细菌均占优势,其次为放线菌门和拟杆菌门细菌。而在纲水平,在7个河口水体中β-变形菌纲细菌占优势,其次为α-变形菌纲细菌和放线菌纲细菌。相关性分析结果表明,水体p H和细菌群落多样性呈显著负相关关系,而总氮和氨态氮含量和细菌群落多样性呈显著正相关性。

全文：本文对鄱阳湖7个河口(赣江、抚河、信江、乐安河、昌江、饶河和修河)水体的理化特性进行了分析,并采用细菌16S r RNA基因Mi Seq测序的方法对其多样性和组成进行了研究。结果表明,乐安河水体总氮含量最高,信江水体总磷含量最高。乐安河、修河和饶河水体细菌丰度高于其它河口,而修河、昌江和饶河水体细菌多样性则相对较高。水体细菌群落组成分析结果表明,在7个河口水体中变形菌门细菌均占优势,其次为放线菌门和拟杆菌门细菌。而在纲水平,在7个河口水体中β-变形菌纲细菌占优势,其次为α-变形菌纲细菌和放线菌纲细菌。相关性分析结果表明,水体p H和细菌群落多样性呈显著负相关关系,而总氮和氨态氮含量和细菌群落多样性呈显著正相关性。

鄱阳湖表层水体细菌群落结构时空变化

作者： 刘倩纯  来源：南昌大学 年份：2013 文献类型 ：学位论文 关键词： rDNA  454高通量测序  鄱阳湖  细菌多样性  DGGE  16S 

描述：菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门：与2010年10月相比,2011年5

全文：菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门：与2010年10月相比,2011年5

鄱阳湖表层水体细菌群落结构时空变化

作者： 刘倩纯  来源：南昌大学 年份：2013 文献类型 ：学位论文 关键词： rDNA  454高通量测序  鄱阳湖  细菌多样性  DGGE  16S 

描述：菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门：与2010年10月相比,2011年5

全文：菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门：与2010年10月相比,2011年5

鄱阳湖表层水体细菌群落结构时空变化

作者： 刘倩纯  来源：南昌大学 年份：2013 文献类型 ：学位论文 关键词： rDNA  454高通量测序  鄱阳湖  细菌多样性  DGGE  16S 

描述：菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门：与2010年10月相比,2011年5

全文：菌(含量1%)均为放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、疣微菌门及变形菌门中的β-变形菌、y-变形菌和α-变形菌。19个门中,WS3是2010年10月份湖口样地独有的菌门：与2010年10月相比,2011年5