鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码

作者： 徐武杰 邹节新 白俊 朱春潮 石林波 张小燕 张萌 汪雁 周宪民  来源：南昌大学学报(理科版) 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  华溪蟹属 

描述：探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。

全文：探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。

基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

全文：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

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基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

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基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

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基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

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基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

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基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究

作者： 秦煊  来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 第二代测序技术  鄱阳湖  环境微生物学  微生物多样性 

描述：(Armatimonadetes)1%、衣原体门(Chlamydiae)1%、TM7(1%);Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes

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基于ONDWI水体指数的鄱阳湖水域信息提取

作者： 丁占峰 李大军  来源：安徽农业科学 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： 水体提取  鄱阳湖  OLI图像  NDWI 

描述：湖泊水体的准确提取在水体灾害监测、水资源利用、防灾抗旱等方面具有重大意义,一般湖泊水体提取的方法受影像阴影、冰雪、云等的影响较大,不利于湖泊水体信息的提取。该研究提出了鄱阳湖水域信息提取的新方法即ONDWI(即Override NDWI)=(NDBNIR)/(NDB+NIR)指数法来进行鄱阳湖水域的水体提取,该方法能有效地去除水体中含有的湿地,同时还能较好地抑制植被和土壤信息。该方法的提出有利于鄱阳湖自然生态水域的水资源保护和水体监测。

全文：湖泊水体的准确提取在水体灾害监测、水资源利用、防灾抗旱等方面具有重大意义,一般湖泊水体提取的方法受影像阴影、冰雪、云等的影响较大,不利于湖泊水体信息的提取。该研究提出了鄱阳湖水域信息提取的新方法即ONDWI(即Override NDWI)=(NDBNIR)/(NDB+NIR)指数法来进行鄱阳湖水域的水体提取,该方法能有效地去除水体中含有的湿地,同时还能较好地抑制植被和土壤信息。该方法的提出有利于鄱阳湖自然生态水域的水资源保护和水体监测。

鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究

作者： 徐武杰  来源：南昌大学医学院 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 

描述：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠

全文：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠