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鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码
作者: 徐武杰 邹节新 白俊 朱春潮 石林波 张小燕 张萌 汪雁 周宪民  来源:南昌大学学报(理科版) 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  华溪蟹属 
描述:探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
全文:探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
作者: 徐武杰  来源:南昌大学医学院 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 
描述:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
全文:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构及mtDNA基因组全序列分析
作者: 曾泰  来源:南昌大学 年份:2014 文献类型 :学位论文 关键词: mtDNA基因组  放逸短沟蜷  鄱阳湖流域  COI  遗传结构 
描述:排列比较分析,有助于蟹守螺超科系统发育地位和关系不明确的分支系统树的重新构建及新进腹足超目mtDNA基因组基因重排进化的研究。主要结果如下:1.鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性和遗传分化通过扩增
全文:排列比较分析,有助于蟹守螺超科系统发育地位和关系不明确的分支系统树的重新构建及新进腹足超目mtDNA基因组基因重排进化的研究。主要结果如下:1.鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性和遗传分化通过扩增
鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
作者: 徐武杰  来源:南昌大学医学院 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 
描述:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
全文:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构及mtDNA基因组全序列分析
作者: 曾泰  来源:南昌大学 年份:2014 文献类型 :学位论文 关键词: mtDNA基因组  放逸短沟蜷  鄱阳湖流域  COI  遗传结构 
描述:排列比较分析,有助于蟹守螺超科系统发育地位和关系不明确的分支系统树的重新构建及新进腹足超目mtDNA基因组基因重排进化的研究。主要结果如下:1.鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性和遗传分化通过扩增
全文:排列比较分析,有助于蟹守螺超科系统发育地位和关系不明确的分支系统树的重新构建及新进腹足超目mtDNA基因组基因重排进化的研究。主要结果如下:1.鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性和遗传分化通过扩增
鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
作者: 徐武杰  来源:南昌大学医学院 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 
描述:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
全文:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构及mtDNA基因组全序列分析
作者: 曾泰  来源:南昌大学 年份:2014 文献类型 :学位论文 关键词: mtDNA基因组  放逸短沟蜷  鄱阳湖流域  COI  遗传结构 
描述:排列比较分析,有助于蟹守螺超科系统发育地位和关系不明确的分支系统树的重新构建及新进腹足超目mtDNA基因组基因重排进化的研究。主要结果如下:1.鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性和遗传分化通过扩增
全文:排列比较分析,有助于蟹守螺超科系统发育地位和关系不明确的分支系统树的重新构建及新进腹足超目mtDNA基因组基因重排进化的研究。主要结果如下:1.鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性和遗传分化通过扩增
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