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鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码
作者: 徐武杰 邹节新 白俊 朱春潮 石林波 张小燕 张萌 汪雁 周宪民  来源:南昌大学学报(理科版) 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  华溪蟹属 
描述:探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
全文:探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
作者: 徐武杰  来源:南昌大学医学院 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 
描述:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
全文:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
作者: 徐武杰  来源:南昌大学医学院 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 
描述:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
全文:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
作者: 徐武杰  来源:南昌大学医学院 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 鄱阳湖流域  DNA条形码  COI  生物地理学  华溪蟹属 
描述:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
全文:分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
鄱阳湖湖泊细菌群落组成及结构——以松门山为例
作者: 寇文伯 黄正云 张杰 刘倩纯 刘芳鹏 刘以珍 吴兰  来源:生态学报 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 鄱阳湖  高通量测序  细菌多样性  细菌群落组成 
描述:于2011年5月在鄱阳湖——松门山湖区采集底泥与表层水样,分别提取了表层水体浮游和底泥微生物基因组DNA,利用454高通量测序技术对细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了湖泊底泥细菌、水体
全文:于2011年5月在鄱阳湖——松门山湖区采集底泥与表层水样,分别提取了表层水体浮游和底泥微生物基因组DNA,利用454高通量测序技术对细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了湖泊底泥细菌、水体
鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
作者: 刘芳鹏  来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌  克隆文库  氨氧化细菌  表层沉积物  鄱阳湖  qPCR  反硝化细菌 
描述:鄱阳湖7个主要入湖口及湖区采集表层沉积物样品,利用古菌16S rDNA片段、氨氧化细菌amoA基因和细菌反硝化nosZ基因这3种分子标记,采用荧光定量PCR、克隆文库构建、系统发育分析和生物统计学等方法
全文:鄱阳湖7个主要入湖口及湖区采集表层沉积物样品,利用古菌16S rDNA片段、氨氧化细菌amoA基因和细菌反硝化nosZ基因这3种分子标记,采用荧光定量PCR、克隆文库构建、系统发育分析和生物统计学等方法
鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
作者: 刘芳鹏  来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌  克隆文库  氨氧化细菌  表层沉积物  鄱阳湖  qPCR  反硝化细菌 
描述:鄱阳湖7个主要入湖口及湖区采集表层沉积物样品,利用古菌16S rDNA片段、氨氧化细菌amoA基因和细菌反硝化nosZ基因这3种分子标记,采用荧光定量PCR、克隆文库构建、系统发育分析和生物统计学等方法
全文:鄱阳湖7个主要入湖口及湖区采集表层沉积物样品,利用古菌16S rDNA片段、氨氧化细菌amoA基因和细菌反硝化nosZ基因这3种分子标记,采用荧光定量PCR、克隆文库构建、系统发育分析和生物统计学等方法
鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
作者: 刘芳鹏  来源:南昌大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: 古菌  克隆文库  氨氧化细菌  表层沉积物  鄱阳湖  qPCR  反硝化细菌 
描述:鄱阳湖7个主要入湖口及湖区采集表层沉积物样品,利用古菌16S rDNA片段、氨氧化细菌amoA基因和细菌反硝化nosZ基因这3种分子标记,采用荧光定量PCR、克隆文库构建、系统发育分析和生物统计学等方法
全文:鄱阳湖7个主要入湖口及湖区采集表层沉积物样品,利用古菌16S rDNA片段、氨氧化细菌amoA基因和细菌反硝化nosZ基因这3种分子标记,采用荧光定量PCR、克隆文库构建、系统发育分析和生物统计学等方法
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