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- 鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码
- 作者： 徐武杰 邹节新 白俊 朱春潮 石林波 张小燕 张萌 汪雁 周宪民 来源：南昌大学学报(理科版) 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： 鄱阳湖流域 DNA条形码 COI 华溪蟹属
- 描述：探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
- 全文：探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
- 鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
- 作者： 徐武杰 来源：南昌大学医学院 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖流域 DNA条形码 COI 生物地理学 华溪蟹属
- 描述：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
- 全文：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
- 鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
- 作者： 徐武杰 来源：南昌大学医学院 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖流域 DNA条形码 COI 生物地理学 华溪蟹属
- 描述：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
- 全文：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
- 鄱阳湖流域并殖吸虫宿主动物华溪蟹属淡水蟹类DNA条形码的初步研究
- 作者： 徐武杰 来源：南昌大学医学院 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 鄱阳湖流域 DNA条形码 COI 生物地理学 华溪蟹属
- 描述：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
- 全文：分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种,提示COI基因片段较16S r DNA、ITS2基因更适合作为鉴定华溪蟹类物种的DNA标准序列。结论:1.使用试剂盒法提取华溪蟹属淡水蟹类步足肌肉,可获得稳定可靠
- 鄱阳湖湖泊细菌群落组成及结构——以松门山为例
- 作者： 寇文伯 黄正云 张杰 刘倩纯 刘芳鹏 刘以珍 吴兰 来源：生态学报 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： 鄱阳湖 高通量测序 细菌多样性 细菌群落组成
- 描述：于2011年5月在鄱阳湖——松门山湖区采集底泥与表层水样,分别提取了表层水体浮游和底泥微生物基因组DNA,利用454高通量测序技术对细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了湖泊底泥细菌、水体浮游细菌群落结构特征。结果显示:底泥细菌OTUs(Operational Taxonomic Units)为1454,表层水体浮游细菌OTUs为269;底泥细菌群落比表层水体更加多样化,底泥细菌的物种数大大多于表层水体。同时,底泥细菌群落与表层浮游细菌群落结构存在显著差异。物种分类显示鄱阳湖底泥细菌种类隶属于20门,228属,其中优势种群为δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia);表层水体浮游细菌隶属于13门116属,优势种群为β-变形菌纲、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。结果进一步揭示,无论是浮游细菌群落还是沉积物细菌群落,优势细菌种群的基因型多样性更高。
- 全文：于2011年5月在鄱阳湖——松门山湖区采集底泥与表层水样,分别提取了表层水体浮游和底泥微生物基因组DNA,利用454高通量测序技术对细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了湖泊底泥细菌、水体浮游细菌群落结构特征。结果显示:底泥细菌OTUs(Operational Taxonomic Units)为1454,表层水体浮游细菌OTUs为269;底泥细菌群落比表层水体更加多样化,底泥细菌的物种数大大多于表层水体。同时,底泥细菌群落与表层浮游细菌群落结构存在显著差异。物种分类显示鄱阳湖底泥细菌种类隶属于20门,228属,其中优势种群为δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia);表层水体浮游细菌隶属于13门116属,优势种群为β-变形菌纲、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。结果进一步揭示,无论是浮游细菌群落还是沉积物细菌群落,优势细菌种群的基因型多样性更高。
- 鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
- 作者： 刘芳鹏 来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 古菌 克隆文库 氨氧化细菌 表层沉积物 鄱阳湖 qPCR 反硝化细菌
- 描述：,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
- 全文：,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
- 鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
- 作者： 刘芳鹏 来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 古菌 克隆文库 氨氧化细菌 表层沉积物 鄱阳湖 qPCR 反硝化细菌
- 描述：,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
- 全文：,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
- 鄱阳湖表层沉积物古菌群落及氮循环功能
- 作者： 刘芳鹏 来源：南昌大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 古菌 克隆文库 氨氧化细菌 表层沉积物 鄱阳湖 qPCR 反硝化细菌
- 描述：,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54
- 全文：,研究鄱阳湖表层沉积物古菌群落和氮循环功能变化,得到以下结果:(1)鄱阳湖表层沉积物古菌群落共划分出3个门,4个纲,6个目,8个科和9个属。3个门分别为Euryarchaeota(广古菌门,48.54